Associated factors of microorganisms causing lower respiratory tract infections in children hospitalized between 2019 and 2022 in a private hospital in Lima, Perú.

内容摘要

Lower respiratory tract infection is the leading cause of childhood death wordwide. Etiological agents showed seasonal, geographic, and pandemic-related variation. To determine the clinical manifestations of respiratory pathogens in children hospitalized due to lower respiratory tract infection before, during, and after the pandemic in a private hospital in Lima, Perú. This is a retrospective cohort study of patients under 13 years of age hospitalized with lower respiratory tract infection. Two multiplex polymerase chain reaction (PCR) tests, CLART Fast PneumoVir™ and PneumoCLART Bacteria®, were used to identify pathogens. We identified factors associated with prolonged hospitalization based on general characteristics and the presence of pathogens. A total of 612 patient records were analyzed. The average age was 2.89 years. Respiratory syncytial virus was identified in 33.66% (206/612) of cases, influenza A in 26.31% (161/612), and Haemophilus sp. in 19.28% (118/612). Before the COVID-19 pandemic, 48.9% of patients had a viral etiologic agent, and 87.78% (115/131) had one after the pandemic. During the pre-pandemic period, 17.34% (77/444) of patients had more than one microorganism, with frequent coinfections of respiratory syncytial virus with Haemophilus sp. (10.78%) (66/612) and respiratory syncytial virus with influenza A virus (8.82%) (54/612). Additionally, the identification of respiratory syncytial virus was associated with prolonged hospital stays of more than 6 days (p = 0.005). This study found that viral etiologic agents were predominant before and after the pandemic. Furthermore, coinfections between bacteria and viruses were frequent. The respiratory syncytial virus was the most common and was associated with coinfections and prolonged hospital stays. La infección de las vías respiratorias inferiores es la causa principal de muerte infantil en el mundo. Los agentes etiológicos mostraron variación estacional, geográfica y relacionada con la pandemia de la COVID-19. Determinar los factores asociados con los agentes patógenos y sus manifestaciones clínicas en niños con infección de las vías respiratorias inferiores, hospitalizados antes, durante y después de la pandemia en un hospital privado de Lima, Perú. Se llevó a cabo un estudio retrospectivo de cohorte de pacientes menores de 13 años hospitalizados por infecciones de las vías respiratorias inferiores. Se utilizaron dos pruebas de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) múltiple, CLART Fast PneumoVir™ y PneumoCLART Bacteria™ para identificar los agentes patógenos. Se determinaron los factores asociados con la hospitalización prolongada según los agentes patógenos que resultaron positivos y las manifestaciones clínicas generales. Se analizaron 612 registros de pacientes. La edad promedio fue de 2,89 años. Se identificó el virus sincitial respiratorio en el 33,66 % (206/612) de los casos, el de la influenza A en el 26,31 % (161/612) y Haemophilus spp. en el 19,28 % (118/612). Antes de la pandemia de COVID-19, el 48,87 % (217/444) de los pacientes tuvo un agente etiológico viral y, en la después de la pandemia, el 87,78 % (115/131). En la prepandemia, el 17,34 % (77/444) tuvo más de un microorganismo, siendo frecuentes las coinfecciones del virus sincitial respiratorio con Haemophilus spp. (10,78 %) (66/612) y del virus sincitial respiratorio con el virus de la influenza A (8,82 %) (54/612). Además, la identificación del virus sincitial respiratorio se asoció con una estancia hospitalaria de 6 o más días (p = 0,005). En este estudio, se encontró que los agentes etiológicos virales fueron predominantes antes y después de la pandemia. Las coinfecciones entre bacterias y virus fueron frecuentes. El virus sincitial respiratorio fue el más frecuente y se asoció con coinfecciones y estancia hospitalaria prolongada.