Emergence of seasonal influenza A(H3N2) variants with immune escape potential warrants enhanced molecular and epidemiological surveillance for the 2025-2026 season.

内容摘要

All of the major antigenic changes in influenza A(H3N2) viruses since 1968 have involved mutations at just nine amino acid positions, called cluster transition sites, surrounding the receptor binding region of the hemagglutinin surface protein. During the Northern Hemisphere (NH) 2024-2025 influenza season, A(H3N2) variants emerged with multiple parallel substitutions affecting cluster transition sites 135, 145, 158, and/or 189, with implications for the 2025-2026 season. Using >24,000 global A(H3) sequences between September 2024 and August 2025, we assessed the nature and frequency of amino acid mutations among emerging NH and Southern Hemisphere (SH) A(H3N2) variants relative to the 2024-2025 subclade J and updated 2025-2026 subclade J.2 vaccine reference strains. We contextualized based on historic amino acid variation among >210,000 global A(H3) sequences since 1968 and publicly available antigenic characterization data relative to 2024-2025 and 2025-2026 vaccine reference strains. Virtually all circulating A(H3N2) viruses in 2024-2025 were subclade J.2. In Europe, about one-third had cluster transition site mutations, mostly T135A with S145N. In North America, more than two-thirds had cluster transition site mutations, including T135K or S145N, with a late-season increase in doubly mutated J.2.3 (N158K + K189R) and J.2.5 (S145N + N158K) subclades. The SH 2025 season showed an increase in J.2.3 and emergence of J.2.4 (T135K + K189R), including a further drifted J.2.4.1 variant with additional N158D and other mutations, recently renamed subclade K. A substantial proportion of J.2.3 and J.2.4 viruses are antigenically distinct from the 2025-2026 influenza vaccine. Influenza A(H3N2) variants with a combination of cluster transition site mutations emerged during the NH 2024-2025 season. A further drifted and vaccine-mismatched variant, called subclade K, arose during the SH 2025 season and is projected to predominate among A(H3N2) viruses for the NH 2025-2026 season. While mismatched vaccines can still provide protection, enhanced genetic, antigenic, and epidemiological (eg, vaccine effectiveness, disease burden) monitoring are warranted to inform risk assessment and response. Toutes les modifications antigéniques majeures aux virus de l'influenza A(H3N2) depuis 1968 découlent des mutations de neuf positions d'acides aminés seulement qui entourent la région des récepteurs de liaison de l'hémagglutinine, une protéine de surface. Pendant la saison 2024–2025 de l'influenza dans l'hémisphére Nord (HN), des variants A(H3N2) ont émergé, dotés de multiples substitutions paralléles qui touchent les positions 135, 145, 158 ou 189, ce qui a des conséquences pour la saison 2025–2026 de l'influenza. Entre septembre 2024 et août 2025, les auteurs ont utilisé plus de 24 000 séquences A(H3) globales pour évaluer la nature et la fréquence des mutations d'acides aminés dans les variants A(H3N2) émergents de l'HN et de l'hémisphére Sud (HS) par rapport à celles des souches référence vaccinale du sous-clade J de 2024–2025 et du sous-clade J.2 de 2025–2026. Ils les ont contextualisées d'aprés la variation historique d'acides aminés de plus de 210 000 séquences d'A(H3) globales depuis 1968 et les données de caractérisation antigénique accessibles au public relatives aux souches de référence vaccinales de 2024–2025 et de 2025–2026. Pratiquement tous les virus A(H3N2) en circulation en 2024–2025 faisaient partie du sous-clade J.2. En Europe, environ le tiers comportait des mutations à diverses positions, notamment T135A et S145N. En Amérique du Nord, plus des deux tiers étaient dotés de mutations à diverses positions, y compris T135K ou S145N, et présentaient une augmentation des sous-clades J.2.3 (N158K+K189R) et J.2.5 (S145N+N158K) qui ont subi une double mutation en fin de saison. La saison 2025 en HS a révélé une augmentation du sous-clade J.2.3 et l'émergence du sous-clade J.2.4 (T135K+K189R), y compris un variant du sous-clade J.2.4.1 qui a subi une dérive plus marquée incluant une mutation supplémentaire à la position N158D et d'autres mutations. Ce variant a récemment reçu le nom de sous-clade K. Une proportion substantielle des virus aux sous-clades J.2.3 et J.2.4 sont distincts sur le plan antigénique de ceux contenus dans le vaccin contre l'influenza pour la saison 2025–2026. Des variants de l'influenza A(H3N2) dotés d'une combinaison de mutations aux diverses positions ont émergé pendant la saison 2024–2025 de l'HN. Un variant ayant subi une dérive génétique plus importante et qui ne concorde pas au vaccin, désormais nommé sous-clade K, a émergé pendant la saison 2025 en HS et devrait prédominer parmi les virus A(H3N2) pour la saison 2025–2026 en HN. Bien que des vaccins non concordants puissent offrir une certaine protection, une surveillance génétique, antigénique et épidémiologique des vaccins (p. ex., leur efficacité) s'impose pour mieux évaluer le risque et la réponse s'y rapportant.